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Nucleotide
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top
Sono costituiti da tre mwgqgruppi:
• uno mwiazucchero a cinque atomi di carbonio (zucchero mwiqpentoso), che insieme alla base azotata costituisce un mwignucleoside
• uno o più mwjagruppi fosfato (residuo fosforico)
Le basi puriniche sono mwjgadenina e mwjwguanina, nel DNA come nell'RNA; le basi pirimidiniche sono mwkacitosina e mwkqtimina nel DNA, citosina e mwkguracile nell'RNA. Lo zucchero pentoso è il mwkwribosio nell'RNA ed il mwladesossiribosio nel DNA. I nucleotidi possono contenere fino a tre gruppi fosfato, che al momento della sintesi dell'acido nucleico vengono ridotti a uno.
Due dei nucleotidi più importanti dal punto di vista metabolico sono l'mwlgadenosina trifosfato (ATP) che funge da fondamentale riserva di energia e la mwlwguanosina monofosfato ciclico (cGMP) che regola importanti processi biologici.cite-ref-treccani-1-1[1]
Contents
• Note
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Struttura chimica
Componenti fondamentali
Un nucleotide è costituito da tre parti:
1. mwogBase azotata: può essere una mwowpurina (adenina o guanina) o una mwpapirimidina (citosina o timina nel DNA, citosina o uracile nell'RNA). Le purine hanno una struttura biciclica (un anello a 6 atomi fuso con uno a 5), mentre le pirimidine sono monocicliche (anello a 6 atomi).
2. mwpgZucchero pentoso
• mwqqRibosio (RNA): formula C₅H₁₀O₅, con un mwqggruppo ossidrile (-OH) al carbonio 2'.
• mwraDesossiribosio (DNA): formula C₅H₁₀O₄, con un mwrqidrogeno (-H) al carbonio 2' invece dell’-OH.
3. mwrwGruppo fosfato: legato al carbonio 5' dello zucchero tramite un legame estere. Nei nucleotidi liberi (cioè non facenti parte di un acido nucleico, come l'ATP), possono essere presenti fino a tre gruppi fosfato (mono-, di- o trifosfato).
Legami chimici
• mwswmwtaLegame glicosidico: collega il carbonio 1' dello zucchero al mwtqgruppo amminico della base azotata (N9 per purine, N1 per pirimidine).
• mwtwLegame fosfodiestere: unisce il fosfato al carbonio 5' di uno zucchero e al carbonio 3' dello zucchero successivo, formando la spina dorsale degli acidi nucleici.
Struttura 3D
• mwvaDNA: forma una doppia elica antiparallela stabilizzata da mwvqlegami idrogeno tra basi complementari (A-T, C-G) e interazioni idrofobiche tra basi impilate.
Differenze tra DNA e RNA
1. Stabilità chimica
• mwxgDNA: la mancanza del gruppo -OH al C2' nel desossiribosio riduce l’idrolisi alcalina, rendendo il DNA più stabile per la conservazione del mwxwmateriale genetico a lungo termine.
• mwyqRNA: il gruppo -OH al C2' del ribosio lo rende suscettibile all’idrolisi in condizioni mwygbasiche, limitandone la durata.
2. Basi azotate
• mwzgDNA: contiene mwzwtimina (mwaa5-metiluracile), che forma due legami idrogeno con l’mwaqadenina. La timina evita errori di replicazione: l’mwaguracile (derivato dalla citosina deaminata) viene riconosciuto come danno e riparato.
• mwbaRNA: utilizza mwbquracile al posto della mwbgtimina. L’uracile richiede meno energia per la sintesi ed è adatto a molecole a breve vita come l’RNA.
3. Struttura e funzioni
DNA
• mwcwStruttura a doppia elica (Watson e Crick, 1953).
• mwdqFunzione primaria Conservazione e trasmissione dell’mwdginformazione genetica.
RNA
• mwegStruttura flessibile Può formare eliche corte, loop e pseudonodi (es. mRNA, rRNA, tRNA).
• mwfaFunzioni diversificate
• mwgwtRNA Adatta i codoni dell’mwhamRNA agli mwhqamminoacidi.
• mwhwrRNA: Componente strutturale e catalitico dei mwiaribosomi.
• mwigRNA non codificanti mwiwRegolazione genica (es. miRNA, siRNA).
Nomenclatura
I nomi dei nucleotidi sono abbreviati in codici standard di tre o quattro lettere. Un'eventuale "mwjgd" iniziale sta per "desossi-", cioè indica che il nucleotide in questione è un mwjwdesossiribonucleotide, come nel DNA; nel caso di un mwkaribonucleotide semplicemente non è presente la "mwkqd", come nell'RNA. La seconda lettera indica il mwkgmwkwnucleoside, e precisamente:
La terza lettera indica la lunghezza della catena di gruppi fosfato attaccata al carbonio 5' dello zucchero. Nel DNA e nell'RNA c'è un solo gruppo fosfato per unità ripetitiva, quindi si utilizza solo il prefisso mono-, abbreviato in M; nella reazione di una DNA o di una RNA polimerasi, invece, ogni desossinucleotide in ingresso nella catena in costruzione è trifosfato, quindi nell'indicarlo si usa il prefisso tri-, abbreviato in T. La quarta lettera indica la presenza di gruppi fosfato (P).
Ad esempio, la desossicitidina 5'-monofosfato è abbreviata con dCMP; la d perché è un mwqgdesossiribonucleotide, la C perché la base azotata contenuta è la mwqwcitosina, "MP" perché lo zucchero che vi si trova (il desossiribosio) è monofosfato al carbonio 5'. (N.B. nella figura che segue sarebbe più corretto parlare di nucleotide monofosfato e nucleotide difosfato e non nucleoside monofosfato e nucleoside difosfato, in quanto è visibile il legame e la presenza della base azotata).
Note
cite-note-treccani-11. ↑ mwuamwuqmwugNucleotide, su mwuwtreccani.it. mwvaURL consultato il 9 ottobre 2025.
Altri progetti
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• Wikizionario
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• Wikizionario contiene il lemma di dizionario «nucleotide»
• Wikimedia Commons contiene immagini o altri file su nucleotide
Collegamenti esterni
• citereftreccani-itnucleotide, su Treccani.it – Enciclopedie on line, Istituto dell'Enciclopedia Italiana.
• citerefenciclopedia-della-scienza-e-della-tecnicaLoredana Verdone, nucleotide, in Enciclopedia della scienza e della tecnica, Istituto dell'Enciclopedia Italiana, 2008.
• citerefbritannica-com(EN) nucleotide, su Enciclopedia Britannica, Encyclopædia Britannica, Inc.
• mwww(EN) IUPAC Gold Book, "nucleotides", su goldbook.iupac.org.